More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3611 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.89 
 
 		 540 aa  658    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 540 aa  1066    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.3 
 
 		 540 aa  973    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  56.11 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  49.54 
 
 		 544 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 		 557 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.1 
 
 		 540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.58 
 
 		 544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.07 
 
 		 544 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.54 
 
 		 547 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 		 549 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.37 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.5 
 
 		 549 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  49.46 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.84 
 
 		 547 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.1 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.83 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.42 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.24 
 
 		 542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 		 543 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.91 
 
 		 550 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  60.33 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  46.42 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.97 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  62.46 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.18 
 
 		 661 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  59.48 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 		 674 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.97 
 
 		 542 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 		 550 aa  350  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  43.72 
 
 		 549 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  55.59 
 
 		 528 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 		 541 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.46 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.24 
 
 		 700 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 		 540 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.54 
 
 		 570 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  48.83 
 
 		 632 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.48 
 
 		 388 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  52.75 
 
 		 539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  54.62 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.37 
 
 		 533 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.84 
 
 		 700 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  48.03 
 
 		 645 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.37 
 
 		 563 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  51.14 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 		 537 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.15 
 
 		 533 aa  331  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.52 
 
 		 392 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.52 
 
 		 392 aa  329  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.33 
 
 		 569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  52.98 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.88 
 
 		 509 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.68 
 
 		 546 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.99 
 
 		 518 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 		 518 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 540 aa  309  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.95 
 
 		 822 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.82 
 
 		 515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  52.69 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.34 
 
 		 515 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1608  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.98 
 
 		 533 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 		 532 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 		 666 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.24 
 
 		 532 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.98 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 		 658 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.71 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.568855  normal  0.477198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1298  methyl-accepting chemotaxis protein  35.29 
 
 		 568 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 539 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 		 541 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 		 541 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 		 567 aa  246  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  33.46 
 
 		 542 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 542 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 541 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.46 
 
 		 574 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  33.09 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.08 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.33 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.02 
 
 		 393 aa  240  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  32.18 
 
 		 541 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 		 393 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  40.87 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 539 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 541 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 541 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0349  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.07 
 
 		 585 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  38.99 
 
 		 535 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>