More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0163 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
85 aa  173  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.90958e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  98.82 
 
 
85 aa  172  1e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  95.29 
 
 
85 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.93871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 
84 aa  160  8e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  85.88 
 
 
85 aa  154  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  87.95 
 
 
84 aa  151  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.53633e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  83.53 
 
 
85 aa  150  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.40306e-15  unclonable  7.87501e-24 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
92 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 
95 aa  134  6e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 
89 aa  131  4e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  75.9 
 
 
93 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  68.24 
 
 
91 aa  128  2e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  129  2e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  127  4e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
84 aa  127  5e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
84 aa  127  5e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
84 aa  127  5e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
84 aa  125  2e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
88 aa  124  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  124  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
85 aa  123  9e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
94 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
84 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.60272e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 
88 aa  121  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
87 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
87 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
92 aa  120  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
88 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
85 aa  120  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  1.36289e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
95 aa  118  2e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.81623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  71.08 
 
 
86 aa  117  4e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
97 aa  117  5e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.33239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
98 aa  117  5e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.56783e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
90 aa  117  5e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
95 aa  117  5e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  117  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  116  8e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
90 aa  116  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
100 aa  116  1e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
100 aa  116  1e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  2.71812e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  68.67 
 
 
93 aa  114  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
91 aa  114  4e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  1.74741e-08 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
103 aa  114  4e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.22269e-09  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  113  9e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  113  9e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  113  9e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
83 aa  112  1e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.79495e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  112  1e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.26179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
89 aa  112  1e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 
88 aa  112  1e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
87 aa  112  1e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.09711e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
91 aa  112  1e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
89 aa  112  2e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 
89 aa  112  2e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  112  2e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
89 aa  112  2e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.11893e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
96 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
85 aa  111  4e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.73 
 
 
85 aa  111  4e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.26464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
96 aa  110  4e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.33026e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  68.24 
 
 
84 aa  111  4e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  5.67704e-05  hitchhiker  6.75699e-13 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
96 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  8.39795e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
89 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
96 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
96 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
96 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.03634e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 
89 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
96 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.52453e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
96 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
96 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.11432e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
89 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  69.41 
 
 
100 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
93 aa  110  7e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
88 aa  110  7e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  9.24332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
89 aa  110  7e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
89 aa  110  8e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
96 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  109  1e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  4.79005e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
98 aa  109  1e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.63692e-08  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
86 aa  109  1e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  109  1e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  63.86 
 
 
95 aa  108  2e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.69897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  108  2e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
93 aa  108  2e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  108  2e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  108  2e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
89 aa  109  2e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
85 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  65.06 
 
 
102 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
89 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
88 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
88 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
88 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
89 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>