108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2855 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  100 
 
 		 330 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  69.06 
 
 		 325 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  70.99 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  51.82 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  54.05 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  50.32 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  52.81 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  50.46 
 
 		 307 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  49.17 
 
 		 295 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  47.9 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  51.83 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  51.83 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  48.99 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  45.78 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 298 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  47.25 
 
 		 298 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  47.25 
 
 		 298 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  47.25 
 
 		 298 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  47.25 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  46.93 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  49.17 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  50.17 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  51.51 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  47.39 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  50.17 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  48.33 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  48.38 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.5 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  47.84 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  48.86 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.17 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  49.17 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  43.45 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  43.69 
 
 		 640 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.02 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.67 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  42.14 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.33 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  41.82 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  44.83 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  45.83 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  44.64 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.55 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  43.77 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  44.93 
 
 		 294 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  43.38 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  37.46 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  40.55 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.18 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  45.74 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 363 aa  169  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.55 
 
 		 584 aa  152  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  61.86 
 
 		 120 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  31.31 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  27.75 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1378  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  28.22 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  34 
 
 		 290 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1236  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 280 aa  46.2  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.8 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  25.85 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  26.2 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  24.59 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.62 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>