More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0023 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  100 
 
 		 477 aa  978    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  63.24 
 
 		 478 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  48.18 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  48.61 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  48.18 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  47.97 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  48.18 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  48.39 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  48.39 
 
 		 473 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  48.18 
 
 		 473 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  47.32 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  46.88 
 
 		 472 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  47.55 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  39.46 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.53 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.63 
 
 		 495 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.9 
 
 		 488 aa  293  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  37.97 
 
 		 499 aa  285  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.68 
 
 		 484 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  36.42 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.66 
 
 		 487 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  34.74 
 
 		 490 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  34.53 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.67 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  34.53 
 
 		 490 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  34.32 
 
 		 493 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  34.32 
 
 		 493 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  34.32 
 
 		 493 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  34.32 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  39.82 
 
 		 482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  34.74 
 
 		 490 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  34.53 
 
 		 536 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.51 
 
 		 491 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.31 
 
 		 491 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.78 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.32 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.39 
 
 		 508 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.32 
 
 		 509 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.53 
 
 		 490 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  35.56 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.97 
 
 		 493 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.54 
 
 		 509 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.19 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  31.72 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.5 
 
 		 486 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.3 
 
 		 490 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  31.78 
 
 		 542 aa  246  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  32.35 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.93 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.78 
 
 		 483 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  32.7 
 
 		 486 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.67 
 
 		 474 aa  233  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  39.31 
 
 		 495 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  32.26 
 
 		 483 aa  227  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.22 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.22 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  33.92 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.4 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.69 
 
 		 485 aa  219  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  32.98 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  32.41 
 
 		 484 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.58 
 
 		 479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.11 
 
 		 485 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.85 
 
 		 483 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.04 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.64 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.64 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.09 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.29 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  35.47 
 
 		 469 aa  201  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.91 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.49 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.11 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.08 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.85 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  27.93 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  31.52 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.68 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.24 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  27.59 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.9 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.6 
 
 		 465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.06 
 
 		 464 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.82 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  27.56 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.81 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  26.01 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  25.49 
 
 		 465 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.19 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  25.79 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2393  Lysine decarboxylase  24.25 
 
 		 762 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.736843  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  24.96 
 
 		 751 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  24.78 
 
 		 751 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.39 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  24.83 
 
 		 749 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4822  lysine decarboxylase  23.49 
 
 		 761 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2134  lysine decarboxylase  23.09 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2182  lysine decarboxylase  23.09 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.198287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1009  lysine decarboxylase  23.26 
 
 		 626 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6447  lysine decarboxylase  23.51 
 
 		 771 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>