158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1587 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  100 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  66.83 
 
 		 205 aa  275  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  53.57 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  52.58 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  52.06 
 
 		 197 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  46.35 
 
 		 200 aa  178  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  45.64 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  39.47 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  31.22 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  43.36 
 
 		 239 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  34.15 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  32.82 
 
 		 247 aa  85.1  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  31.07 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  38.33 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  33.5 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  35.09 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  37.69 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  38.41 
 
 		 263 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  34.55 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  33.5 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  40.15 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  36.79 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  36.27 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  34.88 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  34.93 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  35.75 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  33.92 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  36.92 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  39.02 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  38.46 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  36.15 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  36.15 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  38.14 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  28.48 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  36.62 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  32.54 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  33 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  41.38 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  34.78 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  38.1 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  42.24 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  47.69 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  26.61 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  42.67 
 
 		 89 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  36.89 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  38 
 
 		 102 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  44.44 
 
 		 90 aa  62  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  49.32 
 
 		 97 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  35.59 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  31.29 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  46.38 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  33.98 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  45.16 
 
 		 95 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  45.31 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  43.06 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  41.27 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  44.74 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  39.08 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  43.28 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  32.58 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  27.44 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.47 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  44.29 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  46.27 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  41.03 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  43.42 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  32.95 
 
 		 103 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  44.29 
 
 		 110 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  44.78 
 
 		 92 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  36 
 
 		 89 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  35.35 
 
 		 100 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  38.21 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  46.05 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  40.62 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  32.58 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  28 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  34.29 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  30.61 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  46.03 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  39.71 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  36.25 
 
 		 88 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  40.54 
 
 		 88 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  43.28 
 
 		 104 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.85 
 
 		 93 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>