66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1575 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1575  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00527276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  46.5 
 
 		 241 aa  201  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  40.71 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  31.88 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  28.07 
 
 		 559 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  26.75 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  24.2 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  27.52 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 267 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  22.52 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 572 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2289  hypothetical protein  25.61 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.811706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  23.21 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  32.23 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.64 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 560 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 248 aa  45.4  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  23.77 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  23.58 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  32.69 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.19 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 575 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  29.63 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.29 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  27.48 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  33.65 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.73 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  25.23 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  27.55 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.42 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 244 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 220 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  25.38 
 
 		 266 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.19 
 
 		 233 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>