More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1510 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
310 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
310 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
316 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
305 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
318 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.62 
 
 
312 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
305 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 
295 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
314 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
337 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
299 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
672 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
324 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
581 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 
297 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
374 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
1015 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
277 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
597 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
373 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.19 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.51 
 
 
326 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.8 
 
 
326 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
294 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
318 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.64 
 
 
326 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
331 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
233 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
276 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
326 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
1250 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
320 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
291 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
357 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
344 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
235 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
333 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
275 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
303 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
689 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.18 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.96 
 
 
957 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
347 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
268 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.41 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
777 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  35.35 
 
 
740 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
847 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
1035 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  27.38 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
319 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.7 
 
 
321 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  27.38 
 
 
280 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
1177 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  27.38 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  29.41 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.75 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
397 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  27.38 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
1177 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  27.82 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 
251 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  27.59 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  27.82 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.02 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
364 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.14 
 
 
341 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>