More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3733 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 414 aa  827    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  93.48 
 
 		 414 aa  753    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  52.77 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  57 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  53.01 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  51.44 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  46.81 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  39.42 
 
 		 425 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  43.58 
 
 		 420 aa  282  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  39.42 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 424 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  39.42 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  39.17 
 
 		 424 aa  279  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  39.85 
 
 		 424 aa  278  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  39.02 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  36.08 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  37.9 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.63 
 
 		 413 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  40.34 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  40.49 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  38.54 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.9 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  38.08 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  37.56 
 
 		 424 aa  262  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  38.29 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  41.18 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  38.55 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  40.29 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  40.51 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  35.89 
 
 		 432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  35.92 
 
 		 415 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  39.61 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  41.21 
 
 		 410 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  40.36 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  36.25 
 
 		 412 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  36.01 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  40.55 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  39.15 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  36.88 
 
 		 418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  39.54 
 
 		 408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  36.39 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  36.43 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.16 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  39.42 
 
 		 413 aa  243  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  37.01 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  38.32 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  33.42 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  37.29 
 
 		 432 aa  236  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  34.21 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  37.07 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  37.2 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  35.63 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  37.18 
 
 		 430 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  40 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.21 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  36.73 
 
 		 416 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  38.1 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.73 
 
 		 433 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  37.26 
 
 		 416 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 		 408 aa  226  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  35.73 
 
 		 416 aa  225  9e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  33.58 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  38.3 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  37.26 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.92 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.59 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  38.3 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  38.3 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  39.21 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  39.02 
 
 		 432 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  39.18 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  34.89 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  36.3 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  34.52 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  37.86 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  37.44 
 
 		 422 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  36.6 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  38.07 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  33.5 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  41.46 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  38.77 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  37.81 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  36.96 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  37.44 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  38.31 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  37.1 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.89 
 
 		 424 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  39.66 
 
 		 414 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  31.37 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  38.06 
 
 		 419 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  32.83 
 
 		 408 aa  206  9e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  33.17 
 
 		 412 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  33.17 
 
 		 412 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  36.84 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.64 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  33.17 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>