More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3594 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3594  sun protein  100 
 
 		 448 aa  920    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  98.44 
 
 		 448 aa  909    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  65.1 
 
 		 448 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  58.39 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  56.95 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  52.46 
 
 		 452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  50.67 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  42.13 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  42.02 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  40.53 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  41.03 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  38.36 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  36.77 
 
 		 455 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  42.04 
 
 		 451 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  39.82 
 
 		 444 aa  335  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  38.51 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  39.6 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  38.85 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  39.6 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  39.37 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  39.37 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  39.37 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  39.37 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  39.37 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  38.93 
 
 		 444 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  39.37 
 
 		 444 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  39.46 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  38.93 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  41.24 
 
 		 451 aa  325  9e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  37.72 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  40.04 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  40.04 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  40.04 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  36.3 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  38.31 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  37.78 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  38.84 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.42 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  37.09 
 
 		 443 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  37.5 
 
 		 446 aa  300  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  36.88 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  39.14 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  33.84 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  39.38 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.3 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  36.85 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  35.41 
 
 		 456 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  35.37 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.04 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  33.71 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  34.44 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  34.44 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  32.89 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  36.26 
 
 		 439 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  36.75 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  34.21 
 
 		 432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  35.48 
 
 		 445 aa  246  8e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  37.94 
 
 		 432 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  32.38 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.44 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.56 
 
 		 445 aa  243  7e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  35.22 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.88 
 
 		 448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  37.05 
 
 		 431 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  36.82 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  34.68 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  34.82 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  31.39 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  31.61 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  31.61 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  32.34 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.82 
 
 		 427 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  35.94 
 
 		 427 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.2 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  33.11 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  35.19 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.56 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  36.23 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  32.07 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  33.7 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  35.99 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.71 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  35.27 
 
 		 484 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  34.06 
 
 		 501 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.44 
 
 		 420 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  35.44 
 
 		 420 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  35.44 
 
 		 420 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  35.11 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  31.74 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0561  sun protein  34.38 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.494153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  35.19 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  35.19 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  35.19 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  35.19 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  34.66 
 
 		 427 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  32.26 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  34.15 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  32.18 
 
 		 416 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.71 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>