More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2052 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  47.14 
 
 
747 aa  657  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  50.2 
 
 
797 aa  727  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  49.61 
 
 
806 aa  694  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  47.56 
 
 
740 aa  668  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  48.99 
 
 
839 aa  691  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  45.22 
 
 
760 aa  639  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  49.76 
 
 
837 aa  703  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  48.09 
 
 
836 aa  657  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  48.27 
 
 
781 aa  649  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  48.09 
 
 
836 aa  657  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  48.27 
 
 
781 aa  649  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  52.34 
 
 
787 aa  650  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  52.16 
 
 
836 aa  771  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  44.55 
 
 
782 aa  657  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  48.14 
 
 
762 aa  670  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  3.69581e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
762 aa  670  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  48.41 
 
 
762 aa  674  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  2.5433e-15 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
833 aa  671  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  47.02 
 
 
973 aa  652  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  52.77 
 
 
786 aa  655  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  48.82 
 
 
838 aa  638  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  54.32 
 
 
755 aa  668  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  51.74 
 
 
815 aa  651  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
840 aa  703  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  47.82 
 
 
742 aa  671  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  48.54 
 
 
759 aa  679  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  48.43 
 
 
802 aa  685  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  52.94 
 
 
804 aa  661  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  47.74 
 
 
828 aa  679  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  51.74 
 
 
815 aa  651  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  51.17 
 
 
821 aa  699  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  49.01 
 
 
803 aa  675  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 
747 aa  639  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
743 aa  707  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 
835 aa  667  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  46.73 
 
 
885 aa  692  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.1796e-05 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  51.51 
 
 
872 aa  638  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 
1020 aa  669  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  45.69 
 
 
868 aa  637  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  47.07 
 
 
793 aa  679  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
796 aa  641  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  44.61 
 
 
796 aa  662  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  48.69 
 
 
852 aa  701  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
795 aa  688  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
827 aa  685  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  48.43 
 
 
802 aa  685  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  49.01 
 
 
827 aa  678  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  49.28 
 
 
833 aa  685  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  50.56 
 
 
805 aa  683  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  52.01 
 
 
759 aa  731  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  47.11 
 
 
798 aa  662  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  46.85 
 
 
817 aa  708  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
810 aa  690  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  53.36 
 
 
759 aa  773  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  46.75 
 
 
748 aa  641  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  48.23 
 
 
740 aa  677  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
837 aa  1683  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  48.29 
 
 
797 aa  684  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  50.26 
 
 
829 aa  649  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  49.54 
 
 
818 aa  694  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  46.18 
 
 
826 aa  645  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  55.23 
 
 
824 aa  673  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  48.35 
 
 
837 aa  697  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  47.8 
 
 
758 aa  683  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  47.51 
 
 
826 aa  679  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  50.66 
 
 
1087 aa  669  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  46.47 
 
 
754 aa  681  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  46.45 
 
 
753 aa  668  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  46.87 
 
 
767 aa  637  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  46.11 
 
 
828 aa  666  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  46.52 
 
 
839 aa  679  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  47.92 
 
 
894 aa  691  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  50.07 
 
 
841 aa  686  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  48.76 
 
 
819 aa  669  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
806 aa  695  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  3.37327e-05 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  52.02 
 
 
806 aa  652  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  52.5 
 
 
809 aa  638  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  52.69 
 
 
750 aa  762  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  53.36 
 
 
759 aa  773  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
806 aa  696  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  48.19 
 
 
841 aa  669  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  49.28 
 
 
805 aa  692  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.81926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
767 aa  672  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72293e-11 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
762 aa  671  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  49.28 
 
 
805 aa  694  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97644e-14 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  46.92 
 
 
798 aa  652  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  50.19 
 
 
826 aa  683  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  52.17 
 
 
737 aa  663  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  49.18 
 
 
827 aa  699  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  49.15 
 
 
815 aa  718  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.16614e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  52.98 
 
 
823 aa  684  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  50.68 
 
 
805 aa  702  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 
788 aa  651  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
835 aa  706  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  54.97 
 
 
752 aa  788  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  48.04 
 
 
849 aa  674  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  93.2 
 
 
831 aa  1543  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  50.52 
 
 
838 aa  713  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  45.49 
 
 
895 aa  658  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  51.57 
 
 
758 aa  736  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>