More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2052 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  46.43 
 
 
828 aa  671    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
827 aa  685    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  47.83 
 
 
794 aa  689    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  47.56 
 
 
740 aa  668    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  48.82 
 
 
805 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  44.61 
 
 
796 aa  662    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  48.2 
 
 
826 aa  686    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  46.92 
 
 
798 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  49.14 
 
 
805 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  49.08 
 
 
805 aa  687    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  49.28 
 
 
805 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
743 aa  707    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  52.34 
 
 
787 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  48.41 
 
 
762 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  52.01 
 
 
759 aa  731    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
840 aa  703    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  43.53 
 
 
772 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  52.94 
 
 
804 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.98 
 
 
954 aa  669    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  49.61 
 
 
806 aa  694    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  53.39 
 
 
753 aa  776    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  51.74 
 
 
815 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  53.09 
 
 
724 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  48.27 
 
 
781 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  48.92 
 
 
834 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  52.33 
 
 
767 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  52.77 
 
 
786 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  48.09 
 
 
836 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  48.99 
 
 
839 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  49.14 
 
 
805 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
762 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  54.23 
 
 
747 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  48.69 
 
 
852 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  47.74 
 
 
828 aa  679    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  46.87 
 
 
857 aa  688    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  51.21 
 
 
805 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  49.76 
 
 
837 aa  703    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  48.09 
 
 
836 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  49.01 
 
 
803 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  54.32 
 
 
755 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 
816 aa  677    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  50.2 
 
 
797 aa  727    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  44.55 
 
 
782 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  45.49 
 
 
895 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  44.88 
 
 
796 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 
1020 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
942 aa  660    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  93.2 
 
 
831 aa  1543    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  47.93 
 
 
841 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  53.26 
 
 
818 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  52.81 
 
 
801 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  48.54 
 
 
759 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
833 aa  671    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  47.02 
 
 
973 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  46.73 
 
 
885 aa  692    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  44.82 
 
 
846 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  50.52 
 
 
838 aa  713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  48.14 
 
 
762 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
836 aa  728    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  49.08 
 
 
833 aa  670    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  52.16 
 
 
836 aa  771    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  45.1 
 
 
773 aa  644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  47.07 
 
 
793 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  52.34 
 
 
787 aa  643    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 
747 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  52.84 
 
 
751 aa  694    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  47.04 
 
 
750 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  45.99 
 
 
846 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.2 
 
 
855 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  47.35 
 
 
804 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  48.09 
 
 
889 aa  695    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  48.88 
 
 
889 aa  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  51.57 
 
 
758 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
821 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  48.27 
 
 
781 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  51.74 
 
 
815 aa  651    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  50.56 
 
 
805 aa  683    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  49.01 
 
 
827 aa  678    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  51.51 
 
 
872 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  50.46 
 
 
814 aa  693    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
778 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  51.44 
 
 
815 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  72.61 
 
 
786 aa  1166    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  45.69 
 
 
868 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  51.17 
 
 
821 aa  699    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  48.43 
 
 
802 aa  685    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  54.01 
 
 
928 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  51.12 
 
 
1071 aa  661    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  47.14 
 
 
747 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  47.82 
 
 
742 aa  671    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
844 aa  685    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  46.35 
 
 
809 aa  683    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  48.82 
 
 
838 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  45.22 
 
 
760 aa  639    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
796 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
762 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  45.26 
 
 
778 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  49.28 
 
 
833 aa  685    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  48.43 
 
 
802 aa  685    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
795 aa  688    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>