269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7238 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 129 aa  253  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  75.78 
 
 		 131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  65.04 
 
 		 169 aa  157  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  54.76 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  49.6 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  64.52 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  53.33 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  49.21 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  52.38 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  55.26 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  54.39 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  48 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  47.73 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  43.08 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  43.38 
 
 		 166 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  46.46 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  44.26 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  47.24 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  41.09 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  47.66 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  47.58 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  42.42 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  47.58 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  57.89 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  42.4 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  42.4 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  41.09 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  46.77 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  41.18 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  38.64 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  41.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  41.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  37.4 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  41.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  41.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  41.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  41.94 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  39.01 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  41.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  41.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  38.13 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  38.93 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0156  large conductance mechanosensitive channel protein  52.25 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.024147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  38.93 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  39.16 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  40.46 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  36.3 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  40.56 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  43.75 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  39.55 
 
 		 201 aa  90.1  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  37.78 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  42.19 
 
 		 274 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  38.93 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  36.03 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  39.06 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  39.69 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  35.56 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  37.04 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  43.75 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  41.73 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  42.15 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  34.97 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  41.32 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  38.28 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  37.4 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  41.32 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  40.85 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>