More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6376 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  51.78 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  39.5 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  37.5 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.1 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.62 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.62 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  37.7 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.5 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  43.92 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  39.89 
 
 		 309 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  42.31 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  36.61 
 
 		 181 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  42.31 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.36 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.46 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.46 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  36.76 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  41.15 
 
 		 219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  38.92 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  34.41 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.1 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.59 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.79 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  38.92 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  38.38 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.97 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.88 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  41.49 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.61 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.61 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.24 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.48 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  33.51 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  34.59 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.96 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  34.05 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.11 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  34.05 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.17 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.17 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.17 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  32.99 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 307 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 307 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  44.22 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  39.01 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  32.64 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  34.05 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.3 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  37.63 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.3 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.46 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  34.41 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.05 
 
 		 186 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.05 
 
 		 186 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  34.05 
 
 		 186 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.36 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  40.32 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  36.5 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.3 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.3 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  35.87 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  32.98 
 
 		 183 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.24 
 
 		 197 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  36.61 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  38.22 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  36.79 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  35.87 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  40.14 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  35.33 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.72 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  37.97 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>