28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1061 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 605 aa  1212    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  74.39 
 
 		 613 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  43.9 
 
 		 533 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  47.28 
 
 		 376 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  47.14 
 
 		 351 aa  257  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  43.54 
 
 		 417 aa  256  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  40.22 
 
 		 427 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  45.39 
 
 		 580 aa  249  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  40.67 
 
 		 901 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  35.94 
 
 		 443 aa  231  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  44.21 
 
 		 496 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  43.28 
 
 		 649 aa  206  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  30.9 
 
 		 380 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  28.14 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  29.72 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  28.12 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  25.06 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.67 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  35.11 
 
 		 367 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.16 
 
 		 900 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  30.08 
 
 		 351 aa  50.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  36.99 
 
 		 652 aa  47.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  34.21 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  30.15 
 
 		 360 aa  47  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  25.98 
 
 		 409 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  29.2 
 
 		 348 aa  45.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  31.13 
 
 		 302 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  31.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>