More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2748 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 313 aa  638    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.12 
 
 		 313 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.52 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.84 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.53 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.56 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0441  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000798578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0920  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000171601  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.86 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.27 
 
 		 350 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  36.1 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.49 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.06 
 
 		 398 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.5 
 
 		 443 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.91 
 
 		 397 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  35.02 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3592  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.67 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.63 
 
 		 268 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.03 
 
 		 257 aa  93.2  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27 
 
 		 278 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  28.95 
 
 		 253 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 		 257 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  35.71 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.1 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  32.71 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  34.87 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.31 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  27.76 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.62 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  34.9 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.85 
 
 		 401 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.66 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  28.57 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.62 
 
 		 303 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  33.85 
 
 		 392 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 257 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 279 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  33.33 
 
 		 397 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.1 
 
 		 353 aa  89  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.14 
 
 		 264 aa  89  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  28.1 
 
 		 255 aa  89  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.16 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  25.95 
 
 		 258 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.18 
 
 		 407 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.25 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  27.84 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  35.18 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  27.49 
 
 		 265 aa  87.4  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 		 259 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  30.84 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  27.96 
 
 		 264 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.85 
 
 		 397 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0744  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.52 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000594465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.66 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.62 
 
 		 255 aa  87  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  33.65 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.69 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  34.87 
 
 		 405 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  25.48 
 
 		 262 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 		 405 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  30.73 
 
 		 399 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 		 263 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  28.42 
 
 		 257 aa  85.9  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  30.07 
 
 		 259 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  34.36 
 
 		 405 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.6 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  30.92 
 
 		 259 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.47 
 
 		 255 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.48 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  32.81 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>