More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2363 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  69.32 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  55.06 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  50.55 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  52.87 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  52.51 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  48.35 
 
 		 191 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  51.09 
 
 		 199 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  51.67 
 
 		 194 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  53.14 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  53.07 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6375  hypothetical protein  91.3 
 
 		 103 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  56.77 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  51.11 
 
 		 193 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  53.71 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  53.71 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  49.72 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  48.09 
 
 		 194 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  49.72 
 
 		 185 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 201 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  45.16 
 
 		 201 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  49.16 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  48.09 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  50 
 
 		 193 aa  158  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  48.09 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  53.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  44.81 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 188 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  47.54 
 
 		 309 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  44.32 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  48.07 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  48.09 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  47.54 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  56.67 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 		 193 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 		 193 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  46.24 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  55.43 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 197 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 197 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  48.09 
 
 		 185 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  48.09 
 
 		 185 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  48.89 
 
 		 197 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  47.19 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  52 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  47.69 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  47.69 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  47.69 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 		 193 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  50.86 
 
 		 206 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  46.84 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  44.81 
 
 		 193 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  45.51 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  47.45 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  47.45 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  47.45 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  47.18 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  41.57 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  48.33 
 
 		 184 aa  144  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  47.22 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  44.44 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  47.18 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  49.09 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  44.44 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  44.44 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 199 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  40.74 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  46.45 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  46.99 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  50.28 
 
 		 184 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  46.49 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  40.57 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  44.21 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  43.85 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  43.85 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  43.85 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  48.88 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  43.96 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  41.18 
 
 		 198 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 205 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  41.01 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  41.01 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  46.81 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  48.09 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 183 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>