118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1606 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1606  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1906  phosphopantetheine-binding  69.62 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 		 897 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  37.68 
 
 		 2543 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 		 1835 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  36.11 
 
 		 4048 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  40.58 
 
 		 1616 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  36.99 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  35.9 
 
 		 1820 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  36.23 
 
 		 2103 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.8 
 
 		 1474 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  30.38 
 
 		 1876 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  30.38 
 
 		 4354 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2735  phosphopantetheine-binding  35.14 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.21 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  37.7 
 
 		 6876 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2877  phosphopantetheine-binding  32.91 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  38.71 
 
 		 1190 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  38.71 
 
 		 1190 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  31.51 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5327  phosphopantetheine-binding  34.29 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4619 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  29.73 
 
 		 4874 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 		 1580 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 		 1580 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  29.73 
 
 		 5021 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29828  predicted protein  34.38 
 
 		 4962 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 7157 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 1837 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  33.33 
 
 		 4580 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.93 
 
 		 1559 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  30.99 
 
 		 4429 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  29.73 
 
 		 3818 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 4098 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  33.33 
 
 		 4122 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  33.33 
 
 		 4157 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 4101 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4033  hypothetical protein  43.66 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.460284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.93 
 
 		 1559 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01916  hypothetical protein  30.99 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.41353  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  26.92 
 
 		 2791 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.87 
 
 		 1656 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  33.33 
 
 		 4123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  30.88 
 
 		 5566 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  28.4 
 
 		 5802 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  32.05 
 
 		 1819 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  31.65 
 
 		 1828 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 		 1190 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  37.93 
 
 		 1580 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.1 
 
 		 4151 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  38.98 
 
 		 1537 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  32.35 
 
 		 2460 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  40.35 
 
 		 2846 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3405  phosphopantetheine-binding  32.89 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  29.17 
 
 		 2477 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  43.4 
 
 		 2966 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3489  hypothetical protein  42.25 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.737704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.85 
 
 		 2762 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  27.78 
 
 		 5612 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6560  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273089 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.36 
 
 		 3925 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2782  Beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 		 899 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0331764  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08209  Conidial yellow pigment biosynthesis polyketide synthase (PKS)(EC 2.3.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q03149]  32.79 
 
 		 2157 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.25 
 
 		 3676 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  28.38 
 
 		 5023 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  25.97 
 
 		 4869 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  39.29 
 
 		 5255 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  35.29 
 
 		 2137 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  48.94 
 
 		 1296 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  33.33 
 
 		 3770 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.76 
 
 		 6889 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2456  hypothetical protein  23.68 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  39.06 
 
 		 7149 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  41.51 
 
 		 1744 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  37.93 
 
 		 2376 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  45.83 
 
 		 1035 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1967  amino acid adenylation domain-containing protein  37.5 
 
 		 1087 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0847  condensation domain-containing protein  34.55 
 
 		 940 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.369359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 		 2547 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  30.3 
 
 		 1704 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34.38 
 
 		 4478 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 		 1832 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4741  phosphopantetheine-binding  31.51 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711261  normal  0.224545 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  32.47 
 
 		 3133 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  32.47 
 
 		 3157 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  32.47 
 
 		 3148 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  29.63 
 
 		 1577 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  35.82 
 
 		 1823 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.18 
 
 		 4318 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  28.77 
 
 		 2501 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  30.14 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  30.14 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  30.14 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 		 1698 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  34.92 
 
 		 6661 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5917  phosphopantetheine-binding  41.82 
 
 		 315 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00147293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  32.88 
 
 		 3679 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  43.75 
 
 		 1726 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  30.67 
 
 		 2507 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>