More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5917 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5917  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 315 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00147293 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  36.05 
 
 		 2463 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  42.53 
 
 		 2093 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  41.74 
 
 		 2820 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  42.86 
 
 		 3133 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  42.86 
 
 		 3157 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  42.86 
 
 		 3148 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.83 
 
 		 5953 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.05 
 
 		 6889 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  43.82 
 
 		 2174 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.67 
 
 		 13537 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  41.44 
 
 		 6676 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.2 
 
 		 4318 aa  66.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  47.95 
 
 		 2250 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 1419 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.169022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  44.78 
 
 		 1786 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  43.27 
 
 		 3044 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  39.05 
 
 		 8646 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  45.35 
 
 		 2577 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  41.58 
 
 		 3231 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  53.03 
 
 		 2706 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  44 
 
 		 2258 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  36.84 
 
 		 1322 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.14 
 
 		 9498 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  30.72 
 
 		 1302 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  42.59 
 
 		 2125 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2414  AMP-dependent synthetase and ligase  41.43 
 
 		 1818 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3431  amino acid adenylation domain protein  37.96 
 
 		 1813 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  30.99 
 
 		 974 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  42.7 
 
 		 1083 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4503  amino acid adenylation domain protein  34.38 
 
 		 639 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  47.3 
 
 		 1021 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  34.71 
 
 		 1528 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  43.48 
 
 		 3328 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  39.36 
 
 		 6081 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  43.48 
 
 		 3352 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  43.02 
 
 		 1457 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  43.02 
 
 		 1457 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.24 
 
 		 4531 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  39.36 
 
 		 6006 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  39.36 
 
 		 6072 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  31.82 
 
 		 1069 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  31.73 
 
 		 3453 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  41.67 
 
 		 1795 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  38.57 
 
 		 6661 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  34.41 
 
 		 2626 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  42.05 
 
 		 3219 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 1084 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  41.79 
 
 		 1574 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  43.02 
 
 		 1457 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  49.21 
 
 		 3710 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  40.45 
 
 		 6403 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  31.48 
 
 		 1661 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  33.63 
 
 		 1104 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  35.29 
 
 		 2625 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  38.89 
 
 		 1514 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  43.28 
 
 		 2316 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 		 7168 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  32.74 
 
 		 1136 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3501  polyketide synthase type I  36.27 
 
 		 119 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  43.28 
 
 		 1454 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  43.9 
 
 		 4647 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 7712 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  40.26 
 
 		 1497 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  28.93 
 
 		 4048 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  45.45 
 
 		 2226 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  47.62 
 
 		 2614 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37.61 
 
 		 5328 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  29.63 
 
 		 3021 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  40 
 
 		 1056 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  38.2 
 
 		 3235 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  37.18 
 
 		 5596 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  35.56 
 
 		 1436 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  42.86 
 
 		 2230 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  45.45 
 
 		 1726 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3345  non-ribosomal peptide synthetase  37.25 
 
 		 1059 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  43.16 
 
 		 8915 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 		 3108 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  45 
 
 		 2243 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.06 
 
 		 3308 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  40.22 
 
 		 8914 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  34.18 
 
 		 3093 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 		 4646 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  36.73 
 
 		 2151 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  42.42 
 
 		 1753 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  42.65 
 
 		 4186 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  38.81 
 
 		 2581 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  40.3 
 
 		 2419 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  34.67 
 
 		 2106 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  46.88 
 
 		 3219 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  43.33 
 
 		 1469 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4486  amino acid adenylation domain protein  43.28 
 
 		 1691 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  42.11 
 
 		 3296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  25.38 
 
 		 4354 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  40.91 
 
 		 3639 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0187  syringopeptin synthetase C  43.28 
 
 		 1345 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  37.25 
 
 		 3002 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.56 
 
 		 2156 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  37.86 
 
 		 7310 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  39.68 
 
 		 3824 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>