27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2456 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  173  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2455  histidine kinase  36.23 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  39.73 
 
 		 5023 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  38.36 
 
 		 4874 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  35 
 
 		 5021 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.27 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  38.36 
 
 		 3818 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2877  phosphopantetheine-binding  30.56 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  29.87 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  29.87 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5098  mycolic acid condensase  26.19 
 
 		 1850 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5010  mycolic acid condensase  26.19 
 
 		 1850 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  28.92 
 
 		 1840 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5391  mycolic acid condensase  26.19 
 
 		 1841 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1169  beta-ketoacyl synthase  31.71 
 
 		 1778 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1606  phosphopantetheine-binding  23.68 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  29.17 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  27.14 
 
 		 4588 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  35.53 
 
 		 2260 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.58 
 
 		 2462 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  27.94 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  30.67 
 
 		 1819 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13834  polyketide synthase pks13  28.95 
 
 		 1733 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.924162 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  26.39 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  26.39 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  26.39 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  29.73 
 
 		 1577 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>