More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2907 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  278  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  50.38 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  48.44 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  46.21 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  48.84 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  46.56 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  47.75 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  44.44 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  41.35 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.12 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.22 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  38.05 
 
 		 173 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  41.75 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  37.17 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  38.84 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  38.89 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  38.89 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  37.21 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.39 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  41.44 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  42.42 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  42.73 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  37.31 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  41.12 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  36.04 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.21 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  34.75 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  39.42 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  33.04 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  39.25 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  40.95 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  39.25 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  39.25 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  38.28 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  32.21 
 
 		 172 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1130  hypothetical protein  33.9 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.30959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  37.04 
 
 		 176 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.3 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  38.74 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  35.66 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  36.96 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.04 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  36.61 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  35.34 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  31.58 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  32.09 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  38.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  39.64 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  36.04 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  38.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  38.54 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  36.29 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  33.04 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  40.38 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  38.1 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  38.1 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  38.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  38.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  39.13 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  38.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  38.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  35.19 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.72 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  40.91 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  31.75 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  41.23 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  38.53 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  40.95 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  36.28 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  37.4 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  41.28 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  36.89 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.62 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.62 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  34.86 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  38.89 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  32.14 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  32.17 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  35.65 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  34.95 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  34.23 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  35.48 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  32.76 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  37.14 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  37.14 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  37.14 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.07 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>