More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0244 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  81.29 
 
 		 442 aa  711    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  100 
 
 		 450 aa  906    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  82.69 
 
 		 442 aa  692    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  68.62 
 
 		 443 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  69.57 
 
 		 445 aa  615  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  69.27 
 
 		 441 aa  616  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  67.58 
 
 		 439 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  66 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  65.26 
 
 		 440 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  59.82 
 
 		 442 aa  545  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  56.35 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  57.88 
 
 		 453 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.98 
 
 		 452 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  53.72 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  53.72 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  53.26 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  52.32 
 
 		 452 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  53.49 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.42 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  53.45 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.74 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  53.97 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  55.76 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.4 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  52.82 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.23 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  51.66 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  51.3 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  55.76 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  53.33 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  54.23 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  51.32 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  54.33 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  52.15 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  53.29 
 
 		 449 aa  461  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  53.21 
 
 		 453 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.97 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  52.82 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  50.82 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.67 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  52.19 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.21 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.33 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3515  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  51.21 
 
 		 452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.33 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  52.98 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  50.77 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  53.09 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.45 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  51.01 
 
 		 515 aa  448  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3094  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.87 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0108  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  52.13 
 
 		 463 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  50 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.33 
 
 		 511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  50.22 
 
 		 457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  52.86 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  50.67 
 
 		 515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3440  signal recognition particle protein  50.44 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000127392  hitchhiker  0.000711681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  51.99 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  49.44 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  49.78 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.89 
 
 		 507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  51.38 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  52.39 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  49.56 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2947  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.1 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  48.04 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0516  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.22 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  50.76 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50.76 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  51.31 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  51.31 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>