More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0005 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  46.66 
 
 		 804 aa  674    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.66 
 
 		 804 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  48.27 
 
 		 804 aa  764    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0004  DNA gyrase, B subunit  47.58 
 
 		 813 aa  684    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.821769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  52.23 
 
 		 795 aa  776    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  48.86 
 
 		 805 aa  705    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  56.17 
 
 		 654 aa  645    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2577  DNA gyrase, B subunit  43.6 
 
 		 815 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0788764  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4064  DNA gyrase subunit B  46.78 
 
 		 804 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0861092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  48.8 
 
 		 804 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0112  DNA gyrase, B subunit  44.7 
 
 		 795 aa  660    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.153062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  46.66 
 
 		 804 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  52.87 
 
 		 794 aa  799    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  47.23 
 
 		 814 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  46.73 
 
 		 769 aa  681    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  58.75 
 
 		 638 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  45.61 
 
 		 812 aa  680    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  47.73 
 
 		 805 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  48.49 
 
 		 805 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  48.16 
 
 		 805 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  48.98 
 
 		 806 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  46.54 
 
 		 804 aa  670    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  48 
 
 		 805 aa  721    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  48.25 
 
 		 805 aa  724    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  47.85 
 
 		 805 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0003  DNA gyrase subunit B  47.12 
 
 		 834 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0123108  hitchhiker  0.00974324 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  46.73 
 
 		 769 aa  681    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0004  DNA gyrase, B subunit  47.5 
 
 		 805 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.545421  hitchhiker  0.00000387143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0003  DNA gyrase subunit B  45.62 
 
 		 842 aa  692    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  62.5 
 
 		 633 aa  699    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0003  DNA gyrase subunit B  46.5 
 
 		 823 aa  700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0806649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0004  DNA gyrase subunit B  47.58 
 
 		 813 aa  675    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0791906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0319  DNA gyrase, B subunit  43.64 
 
 		 814 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  47.08 
 
 		 807 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  47.59 
 
 		 805 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0657  DNA gyrase, B subunit  48.44 
 
 		 861 aa  733    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  52.36 
 
 		 795 aa  781    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0003  DNA gyrase, B subunit  46.04 
 
 		 859 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.202279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  58.55 
 
 		 644 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1285  DNA gyrase, B subunit  44.51 
 
 		 852 aa  660    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  59.1 
 
 		 637 aa  643    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  46.99 
 
 		 804 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  51.94 
 
 		 795 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  48.67 
 
 		 797 aa  715    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  46.53 
 
 		 813 aa  689    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2054  DNA gyrase subunit B  45.73 
 
 		 770 aa  658    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  59.54 
 
 		 641 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0003  DNA gyrase subunit B  45.92 
 
 		 810 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.835475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  48.21 
 
 		 805 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  58.54 
 
 		 634 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03480  DNA gyrase subunit B  47.27 
 
 		 814 aa  689    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  47.24 
 
 		 804 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 813 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  47.24 
 
 		 804 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.28 
 
 		 675 aa  638    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0721  DNA gyrase, B subunit  44.51 
 
 		 783 aa  652    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  46.66 
 
 		 804 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  46.67 
 
 		 808 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  47.05 
 
 		 813 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  47.17 
 
 		 798 aa  694    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0095  DNA gyrase, B subunit  47.65 
 
 		 814 aa  692    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0142901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  47.81 
 
 		 805 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  59.89 
 
 		 632 aa  691    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 813 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  46.84 
 
 		 805 aa  691    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 825 aa  1691    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1346  DNA gyrase subunit B  45.95 
 
 		 809 aa  680    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0004  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 768 aa  656    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0782517  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  44.99 
 
 		 802 aa  670    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  59.68 
 
 		 879 aa  656    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5333  DNA gyrase, B subunit  45.65 
 
 		 808 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.248882  normal  0.0644472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  45.68 
 
 		 832 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0004  DNA gyrase, B subunit  47.92 
 
 		 805 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.801274  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  55.81 
 
 		 644 aa  639    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  47.01 
 
 		 806 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  46.19 
 
 		 812 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  56.53 
 
 		 652 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48 
 
 		 813 aa  685    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  0.00000000705515 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1850  DNA gyrase subunit B  46.15 
 
 		 769 aa  658    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 804 aa  685    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  46.84 
 
 		 811 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.54 
 
 		 807 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  49.1 
 
 		 805 aa  724    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  46.95 
 
 		 805 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.64 
 
 		 633 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0014  DNA gyrase subunit B  45.98 
 
 		 800 aa  679    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  47.24 
 
 		 804 aa  673    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0157  DNA gyrase subunit B  45.55 
 
 		 830 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374605  normal  0.0722836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  46.66 
 
 		 804 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  47.44 
 
 		 806 aa  681    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  62.46 
 
 		 633 aa  662    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  60.14 
 
 		 628 aa  693    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  48.62 
 
 		 808 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  48.37 
 
 		 812 aa  729    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  47.92 
 
 		 805 aa  682    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  52.17 
 
 		 802 aa  776    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  59.46 
 
 		 643 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  47.83 
 
 		 814 aa  688    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000127648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.14 
 
 		 805 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  49.15 
 
 		 798 aa  716    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>