More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0653 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 128 aa  259  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  41.8 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  40.83 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  39.45 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  37.17 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  47.95 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  48.53 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  31.97 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  35.29 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  39.13 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 333 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 333 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 329 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 328 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  31.15 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  38.67 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  35.83 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  33.88 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  33.88 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  30.95 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  31.15 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  31.62 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  39.24 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 328 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 328 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 329 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  43.08 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 482 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>