More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0003 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  83.06 
 
 
429 aa  733  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  93.22 
 
 
428 aa  803  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  93.22 
 
 
428 aa  802  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  93.46 
 
 
428 aa  804  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  93.22 
 
 
428 aa  802  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  93.22 
 
 
428 aa  802  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  99.77 
 
 
428 aa  879  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  99.53 
 
 
428 aa  877  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  100 
 
 
428 aa  882  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  83.29 
 
 
429 aa  736  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  83.29 
 
 
426 aa  736  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  90.16 
 
 
428 aa  803  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  99.77 
 
 
428 aa  879  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  99.53 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  99.77 
 
 
428 aa  879  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  81.46 
 
 
429 aa  698  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  99.77 
 
 
428 aa  879  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  99.53 
 
 
428 aa  877  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  84.71 
 
 
429 aa  744  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  80.99 
 
 
429 aa  696  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  80.24 
 
 
429 aa  703  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  99.77 
 
 
428 aa  879  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  79.53 
 
 
429 aa  707  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  68.08 
 
 
425 aa  599  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  67.76 
 
 
426 aa  597  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  67.76 
 
 
425 aa  594  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  67.29 
 
 
426 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  67.61 
 
 
426 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  66.9 
 
 
427 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  65.96 
 
 
427 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  61.85 
 
 
427 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  61.47 
 
 
434 aa  542  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  60.33 
 
 
427 aa  506  1e-142  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  60.81 
 
 
427 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  60.81 
 
 
427 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  60.81 
 
 
427 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  59.67 
 
 
427 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  60.57 
 
 
427 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  60.1 
 
 
427 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  58.35 
 
 
426 aa  493  1e-138  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  59.14 
 
 
427 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  58.91 
 
 
427 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  57.82 
 
 
426 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  57.35 
 
 
428 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  58.91 
 
 
427 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  58.91 
 
 
427 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  59.86 
 
 
428 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  56.53 
 
 
426 aa  482  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  45.85 
 
 
435 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  46.68 
 
 
429 aa  359  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  42.82 
 
 
434 aa  353  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  43.88 
 
 
439 aa  352  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  42.73 
 
 
435 aa  345  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  42.86 
 
 
453 aa  340  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  43.26 
 
 
435 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  41.24 
 
 
438 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  42.89 
 
 
438 aa  327  4e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  43.11 
 
 
438 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  42.79 
 
 
437 aa  322  9e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  41.15 
 
 
439 aa  322  9e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  42.2 
 
 
438 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  41.95 
 
 
439 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  40.05 
 
 
448 aa  300  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  37.36 
 
 
447 aa  285  1e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  38.89 
 
 
428 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  41.69 
 
 
428 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  37.76 
 
 
436 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  33.41 
 
 
465 aa  259  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  35.28 
 
 
461 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.11335e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  40.14 
 
 
432 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  36.09 
 
 
462 aa  254  2e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  35.15 
 
 
460 aa  254  2e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  34.12 
 
 
471 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  36.49 
 
 
433 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  35.4 
 
 
470 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  40.45 
 
 
434 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  35.18 
 
 
470 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  33.7 
 
 
463 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  36.26 
 
 
433 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  33.7 
 
 
463 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.62 
 
 
469 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  33.99 
 
 
461 aa  245  1e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  32.96 
 
 
468 aa  245  1e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  33.77 
 
 
461 aa  244  2e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  34.56 
 
 
469 aa  244  2e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  34.77 
 
 
469 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  34.77 
 
 
469 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  35.62 
 
 
469 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  34.27 
 
 
461 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  34.56 
 
 
469 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  34.07 
 
 
465 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  35.11 
 
 
432 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  34.26 
 
 
469 aa  241  3e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  34.27 
 
 
469 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  34.05 
 
 
469 aa  239  6e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  34.32 
 
 
467 aa  239  7e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  33.12 
 
 
460 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.35451e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  32.68 
 
 
470 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  35.46 
 
 
469 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  34.62 
 
 
473 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>