66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5275 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  98.51 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  98.51 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  98.51 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  98.51 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  98.51 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  98.51 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  98.51 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  98.51 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  88.06 
 
 
201 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  87.56 
 
 
201 aa  353  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  87.56 
 
 
201 aa  353  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  86.57 
 
 
201 aa  350  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  86.07 
 
 
201 aa  349  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  80.6 
 
 
201 aa  334  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  59.2 
 
 
206 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  56.28 
 
 
210 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  55.78 
 
 
216 aa  224  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  53.77 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  51.76 
 
 
202 aa  207  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  50.25 
 
 
202 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  47.32 
 
 
207 aa  201  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  46.45 
 
 
213 aa  201  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  38.89 
 
 
207 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  39.41 
 
 
211 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  37.81 
 
 
211 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  36.82 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  34.18 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  31.96 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  26.63 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  26.63 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  25.91 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  26.94 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  27.98 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  27.98 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  27.98 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  27.98 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  29.06 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  25.91 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  26.42 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  26.53 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  26.94 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  29.35 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  29.59 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  29.05 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  28.82 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  30.6 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  26.8 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  27.84 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  29.08 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  26.8 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  25.26 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  25.26 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  25.26 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  25.26 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  26.6 
 
 
216 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  24.71 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  23.96 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  24.88 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  24.71 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  27.41 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  28 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  26.8 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  21.5 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  21.5 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  25.42 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>