More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2804 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 303 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  57.97 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  47.95 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 331 aa  222  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  37.68 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  35.47 
 
 		 326 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 		 338 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  42.15 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  40.23 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  38.57 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  41.7 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  37.67 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  36.43 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 304 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  37.32 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  38.1 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  37.2 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  43.82 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  38.62 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  33.8 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  40.64 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  36.36 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  38.89 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  38.89 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  39.03 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  37.27 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.7 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  43.19 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  37.96 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  39.68 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  38.55 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  38.52 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.35 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  36.22 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  38.55 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  27.04 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.23 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  37.26 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  26.74 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  24.17 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  27.48 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  26.59 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  26.56 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  26.56 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  26.56 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  31.8 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  23.51 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  26.45 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  29.61 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  26.59 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  25.79 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  28.9 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>