More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1812 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1812  glucose inhibited division protein  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0848  glucose inhibited division protein  65.84 
 
 
258 aa  264  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2293  methyltransferase GidB  47.25 
 
 
229 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0745  glucose inhibited division protein  49.77 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1605  glucose inhibited division protein  49.71 
 
 
214 aa  158  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1318  methyltransferase GidB  46.27 
 
 
219 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0582047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  34.31 
 
 
222 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  34.31 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  30.21 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  30.16 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.43 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  29.69 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  29.69 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  29.69 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  29.69 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.95 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  30.21 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  30.21 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  30.21 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  36.04 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  30.21 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  30.21 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  29.84 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  30.21 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30.48 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  30.21 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  31.96 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  29.45 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  31.41 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  30.24 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  32.12 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  32.12 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.1 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  31.01 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  32.5 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  26.9 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  30.77 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  26.06 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  30.61 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  30.61 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  29.65 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  29.07 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  30.32 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  31.54 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  27.62 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  29.26 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  32.79 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  35.37 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  30.32 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  28.85 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  25.45 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  32.82 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  29.53 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  28.92 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  27.78 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  32.62 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  31.67 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  27.17 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  29.82 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2597  methyltransferase GidB  33.11 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.059803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  31.16 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  34.81 
 
 
227 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  30.16 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.29 
 
 
215 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0404  methyltransferase GidB  32.02 
 
 
490 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  30.49 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  29.29 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  37.5 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  37.5 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  29.05 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  33.7 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  31.21 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  26.71 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  31.21 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  29.1 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1152  methyltransferase GidB  30.59 
 
 
498 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal  0.598174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  27.68 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  27.68 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  24.52 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  29.28 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  31.77 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  28.9 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  26.67 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  29.61 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  33.1 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  30.99 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  28.32 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  26.34 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  25.4 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  27.43 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>