More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2040 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 369 aa  743    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  63.72 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  62.61 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  60.24 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  53.85 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0012  methionyl-tRNA formyltransferase  50.31 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  49.66 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  49.49 
 
 		 319 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  47.6 
 
 		 314 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  49.32 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  49.32 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  49.32 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  49.49 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  52.7 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  43.4 
 
 		 318 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  44.86 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  48.24 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  44.79 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  45.62 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 315 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  42.5 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 316 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  44.48 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  44.1 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  43.03 
 
 		 332 aa  249  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  44.38 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  41.88 
 
 		 318 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 		 324 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  44.2 
 
 		 315 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.03 
 
 		 315 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  44.38 
 
 		 307 aa  246  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  44.2 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  44.2 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  44.2 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  44.2 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  44.06 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  41.07 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  50.82 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.65 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  41.74 
 
 		 311 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  42.72 
 
 		 314 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  43.63 
 
 		 320 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  41.93 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  43.26 
 
 		 318 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  42.72 
 
 		 314 aa  242  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 		 348 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 315 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  40.31 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.45 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  40.75 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  50.41 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  41.56 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  49.41 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.45 
 
 		 321 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 		 306 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  43.89 
 
 		 315 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 315 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 315 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 		 306 aa  239  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  42.63 
 
 		 315 aa  239  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  51.46 
 
 		 311 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  42.51 
 
 		 313 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  43.96 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 318 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 319 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.81 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  50.34 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  44.38 
 
 		 310 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  38.3 
 
 		 319 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  47.06 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.81 
 
 		 308 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  48.19 
 
 		 361 aa  232  9e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  37.23 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  37.23 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.57 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  51.04 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  37.19 
 
 		 314 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>