37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1960 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
484 aa  970    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  35.64 
 
 
612 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  32.14 
 
 
834 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.98 
 
 
1009 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.88 
 
 
1842 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  31.17 
 
 
1328 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.56 
 
 
2036 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  30.36 
 
 
1241 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  31.6 
 
 
656 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  35.07 
 
 
1311 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  34.01 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  32.16 
 
 
626 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  28.84 
 
 
809 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.27 
 
 
1969 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  31.22 
 
 
635 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.54 
 
 
2272 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  27.36 
 
 
1067 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 
797 aa  107  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  84.91 
 
 
2392 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  78.18 
 
 
1143 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  66.67 
 
 
1732 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  69.81 
 
 
1502 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  57.81 
 
 
556 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  66 
 
 
2031 aa  77  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1977  hypothetical protein  56.92 
 
 
875 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00338122  hitchhiker  0.000166946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  62.75 
 
 
967 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.31 
 
 
1812 aa  65.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  25 
 
 
1533 aa  64.3  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.49 
 
 
1682 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  32.14 
 
 
322 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.92 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  26.91 
 
 
322 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  38.57 
 
 
652 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  31.9 
 
 
1126 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  35.42 
 
 
2122 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
774 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  31.82 
 
 
322 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>