More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3773 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 488 aa  978    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 488 aa  978    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 		 456 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 493 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  49.62 
 
 		 276 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  41.29 
 
 		 425 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  48.32 
 
 		 270 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 469 aa  230  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 443 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 443 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 717 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 480 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 464 aa  203  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  28.76 
 
 		 425 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  40.77 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 494 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  31.28 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 444 aa  192  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 451 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.86 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 469 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 425 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 428 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  37.19 
 
 		 499 aa  189  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  39.85 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 463 aa  187  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  40.96 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  33.4 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  37.76 
 
 		 391 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  31.25 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 439 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 440 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 428 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 453 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 462 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 440 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 462 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  37.55 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  34.81 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  37.35 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 349 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  36.73 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 438 aa  180  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 443 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 488 aa  180  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  37.14 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  35.71 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 437 aa  177  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  29.44 
 
 		 474 aa  176  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  34.36 
 
 		 344 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 488 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  41.97 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  26.77 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 450 aa  173  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>