More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2105 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  631  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  67.24 
 
 		 299 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  61.59 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  52.61 
 
 		 268 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  52.63 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  52.1 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  52.26 
 
 		 274 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  51.92 
 
 		 268 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  52.46 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  51.88 
 
 		 292 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  53.02 
 
 		 285 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  55.48 
 
 		 303 aa  305  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  53.02 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  57.95 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  55.47 
 
 		 292 aa  301  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  52.67 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  55.17 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  51.79 
 
 		 284 aa  295  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  53.85 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  53.52 
 
 		 301 aa  292  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  51.72 
 
 		 287 aa  292  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  53.85 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  54.61 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  53.7 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  52.87 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  54.74 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  53.33 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  52.53 
 
 		 301 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  52 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  50.7 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  50.94 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  51.82 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  51.33 
 
 		 289 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  51.53 
 
 		 272 aa  277  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  53.52 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  53.31 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  49.49 
 
 		 319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  49.49 
 
 		 319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  49.49 
 
 		 319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  49.49 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  49.66 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  51.88 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.4 
 
 		 304 aa  258  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  48.39 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  49.81 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  47.1 
 
 		 288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  46.27 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  47.92 
 
 		 285 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.38 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  45.77 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  44.87 
 
 		 294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  45.33 
 
 		 342 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  44.29 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  45.56 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  47.67 
 
 		 276 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  44.49 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  45.7 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  44.44 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  43.53 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  43.75 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.02 
 
 		 175 aa  195  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  40.15 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  61.54 
 
 		 147 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  41.84 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  45.62 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  43.35 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  44.31 
 
 		 249 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  43.56 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  44.58 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  44.3 
 
 		 266 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  43.98 
 
 		 267 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  43.83 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  45.34 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  47.59 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  43.71 
 
 		 248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  45.51 
 
 		 243 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  41.1 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  44.31 
 
 		 245 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  42.17 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  46.71 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  43.66 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  42.51 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  35.37 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  44.31 
 
 		 242 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  41.07 
 
 		 225 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  43.67 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  41.01 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  44.1 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  36.67 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  39.33 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  40.45 
 
 		 239 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  46.9 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  39.33 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  39.89 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  40.32 
 
 		 218 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  43.29 
 
 		 260 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  43.48 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  41.98 
 
 		 252 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  41.72 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>