More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2048 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  79.75 
 
 		 163 aa  260  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  76.69 
 
 		 163 aa  257  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  74.85 
 
 		 163 aa  247  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 163 aa  246  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0677  30S ribosomal protein S5  72.84 
 
 		 170 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.780274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 169 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 169 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 169 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  207  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  63.92 
 
 		 166 aa  204  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  62.89 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  62.66 
 
 		 167 aa  200  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  62.18 
 
 		 162 aa  200  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  64.05 
 
 		 171 aa  200  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  61.18 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  194  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  59.62 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  62.16 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  60.39 
 
 		 166 aa  190  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  59.88 
 
 		 168 aa  188  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 168 aa  187  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 168 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  62.84 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 		 162 aa  184  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 		 162 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 162 aa  184  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  55.06 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  58.9 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 165 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 165 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  59.33 
 
 		 161 aa  180  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  61.07 
 
 		 175 aa  180  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  58.17 
 
 		 192 aa  180  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  56.6 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 210 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 		 176 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0337  30S ribosomal protein S5  56.49 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00106169  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 		 176 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  55.62 
 
 		 169 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  59.06 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  55.21 
 
 		 185 aa  175  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 172 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 172 aa  175  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 185 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 205 aa  175  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  57.24 
 
 		 199 aa  175  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 200 aa  174  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  51.27 
 
 		 172 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 172 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  54.43 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 197 aa  174  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 171 aa  174  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2307  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 165 aa  174  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0511  30S ribosomal protein S5  53.8 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.478223  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  56.29 
 
 		 210 aa  173  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 166 aa  173  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  51.27 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0475  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>