More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2027 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  100 
 
 
396 aa  801    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  62.56 
 
 
397 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  60.71 
 
 
393 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  60.36 
 
 
394 aa  488  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  58.88 
 
 
398 aa  484  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  59.75 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  56.6 
 
 
398 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  56.6 
 
 
398 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  52.32 
 
 
395 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  57.44 
 
 
400 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  48.2 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  48.81 
 
 
396 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 
397 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  47.35 
 
 
398 aa  378  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  46.91 
 
 
393 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  45.79 
 
 
395 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  46.03 
 
 
397 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  45.5 
 
 
396 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  43.57 
 
 
397 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  46.03 
 
 
398 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  44.09 
 
 
393 aa  351  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  44.97 
 
 
397 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  42.89 
 
 
395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  38.5 
 
 
393 aa  289  6e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  41.49 
 
 
393 aa  289  8e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  36.41 
 
 
394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.7 
 
 
396 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  37.31 
 
 
393 aa  257  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  34.78 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  33.69 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  34.22 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
397 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  34.11 
 
 
404 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  32.25 
 
 
405 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  33.01 
 
 
389 aa  186  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  28.35 
 
 
403 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  31.41 
 
 
389 aa  173  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  31.84 
 
 
387 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.98 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  33.42 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  27.72 
 
 
375 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  31.26 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 
388 aa  163  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  30.08 
 
 
402 aa  162  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  33.24 
 
 
396 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  32.71 
 
 
396 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  32.57 
 
 
392 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  33.24 
 
 
396 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  32.71 
 
 
396 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  32.71 
 
 
396 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  32.71 
 
 
396 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  32.71 
 
 
396 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  31.66 
 
 
367 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  32.07 
 
 
397 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  32 
 
 
404 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  33.24 
 
 
396 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  30 
 
 
389 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  30.77 
 
 
389 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  32.98 
 
 
396 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  30 
 
 
389 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  32.83 
 
 
399 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 
382 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
397 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  29.35 
 
 
387 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  32.71 
 
 
396 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.37 
 
 
390 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 
381 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  30.61 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  30.75 
 
 
388 aa  156  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  32.11 
 
 
393 aa  156  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
400 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 
377 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  32.23 
 
 
404 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  32.05 
 
 
377 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  28.3 
 
 
375 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 
375 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  30.89 
 
 
385 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  30.53 
 
 
401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  29.02 
 
 
373 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 
400 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.64 
 
 
392 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 
402 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  31.14 
 
 
402 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  29.97 
 
 
392 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  34.2 
 
 
400 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  30.51 
 
 
386 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  32.99 
 
 
400 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  28.24 
 
 
397 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  32.8 
 
 
402 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 
392 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 
396 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  27.53 
 
 
377 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  29.88 
 
 
402 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  30.21 
 
 
393 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  29.18 
 
 
373 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>