41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2425 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2425  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1131    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000103631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1023  hypothetical protein  29.76 
 
 		 534 aa  193  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.452518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1158  hypothetical protein  26.12 
 
 		 454 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.815616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3539  hypothetical protein  24.86 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0501  hypothetical protein  25.16 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1661  hypothetical protein  28.57 
 
 		 885 aa  67  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0304  hypothetical protein  21.25 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.242049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1553 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.26 
 
 		 1684 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1030  hypothetical protein  26.36 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.417426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 		 1686 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.47 
 
 		 1481 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1510 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3707  hypothetical protein  22.17 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.73 
 
 		 1398 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 		 969 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2712  hypothetical protein  32.03 
 
 		 418 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.96 
 
 		 1766 aa  50.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.23 
 
 		 1364 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.27 
 
 		 1357 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  24.83 
 
 		 1183 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 		 1161 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.81 
 
 		 1040 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 		 1161 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1491 aa  47  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.4 
 
 		 1609 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.95 
 
 		 1823 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.51 
 
 		 1042 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  22.93 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  23.53 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1042 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  23.16 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.51 
 
 		 740 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.89 
 
 		 1217 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.45 
 
 		 344 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.01 
 
 		 1229 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  27.46 
 
 		 1090 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2557  hypothetical protein  29.85 
 
 		 451 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.77 
 
 		 395 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.12 
 
 		 344 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>