More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0720 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  72.47 
 
 		 179 aa  280  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  67.04 
 
 		 179 aa  275  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 179 aa  271  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 179 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 179 aa  266  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 179 aa  264  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  69.14 
 
 		 183 aa  263  7e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  256  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 178 aa  255  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  253  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 180 aa  251  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 180 aa  251  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  250  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 180 aa  248  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 223 aa  248  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 180 aa  246  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 180 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  60.92 
 
 		 180 aa  242  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  58.19 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  62.07 
 
 		 180 aa  240  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 181 aa  239  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  238  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 180 aa  237  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.18 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  59.06 
 
 		 220 aa  236  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60.92 
 
 		 191 aa  236  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 182 aa  236  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  56.07 
 
 		 192 aa  235  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  56.18 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>