More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_703 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  89.06 
 
 		 265 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0797  stationary phase survival protein SurE  88.97 
 
 		 265 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000405923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  40.83 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.04 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  42.55 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  40.82 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  40.41 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.61 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  37.97 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  40.34 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  43.1 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  42.74 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  38.33 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  41.28 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  42.37 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  36.97 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  39.15 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  35.92 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  39.41 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  39.48 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  41.22 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  42.26 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  35.48 
 
 		 254 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  40.43 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  40.43 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  40.43 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  39.58 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  39.57 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.02 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  39.57 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  39.57 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  39.57 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  37.71 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  36.44 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  39.15 
 
 		 249 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  37.64 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.37 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  38.91 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  38.91 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  37.87 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  38.14 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  38.14 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  35.27 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 270 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  34.48 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  36.73 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  36.73 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>