More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1041 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  92.21 
 
 		 398 aa  760    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  89.45 
 
 		 398 aa  748    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  825    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  52.99 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  52.6 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  50.78 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  51.03 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  51.51 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.07 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  48.96 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  49.36 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  49.75 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  51.02 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  50.64 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  48.97 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.75 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  48.2 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  46.09 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.92 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  48.99 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  45.98 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.6 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.03 
 
 		 399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  47.81 
 
 		 403 aa  359  6e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.08 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  47.63 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  48.42 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  47.68 
 
 		 395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  47.04 
 
 		 396 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  46.17 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.86 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.11 
 
 		 427 aa  348  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  46.73 
 
 		 426 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  46.8 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.19 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  47.34 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  47.34 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 		 385 aa  346  4e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  46.41 
 
 		 427 aa  345  8.999999999999999e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  47.07 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  46.33 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  47.07 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 		 385 aa  342  7e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  46.81 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  47.07 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  47.07 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  45.76 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  44.64 
 
 		 418 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.23 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.61 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  44.64 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.3 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.52 
 
 		 406 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  46.86 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  46.28 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  46.28 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  46.28 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.79 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.52 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  46.01 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  46.01 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  46.01 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  46.01 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  44.5 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  45.31 
 
 		 380 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  44.25 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  45.55 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  45.5 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.01 
 
 		 394 aa  330  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.86 
 
 		 406 aa  329  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  44.44 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  43.49 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.3 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  46.05 
 
 		 405 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.24 
 
 		 406 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  43.23 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.02 
 
 		 436 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  43.34 
 
 		 391 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  44.44 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  45.83 
 
 		 510 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 		 403 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  42.96 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.79 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.13 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  42.13 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  42.01 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.51 
 
 		 383 aa  315  7e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 414 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.04 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.31 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.75 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  43.62 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0484  succinylornithine transaminase family  44.83 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.75 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>