More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2243 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2243  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 339 aa  655    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  45.3 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.64 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0346  transcriptional regulator, LacI family  40.62 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35310  transcriptional regulator, LacI family  40.52 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263381  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1119  transcriptional regulator, LacI family  44.41 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.66 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  43.11 
 
 		 375 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5101  LacI family transcription regulator  39.07 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4716  LacI family transcription regulator  39.07 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4802  LacI family transcription regulator  39.07 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.55 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2982  transcriptional regulator, LacI family  44.38 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000384304  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4919  transcriptional regulator, LacI family  38.28 
 
 		 358 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.15 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13608  LacI family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2718  transcriptional regulator, LacI family  38.73 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.204137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1737  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.000686199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1633  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1526  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2691  transcriptional regulator, LacI family  39.26 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  37.01 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1521  LacI family transcription regulator  36.29 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6966  LacI family transcription regulator  36.29 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6308  LacI family transcription regulator  36.29 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2909  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  33.8 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.420519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  35.9 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3821  LacI family transcription regulator  38.18 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02629  Transcriptional regulator  35.38 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07700  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.241125  normal  0.0525574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0601  transcriptional regulator, LacI family  36.07 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.55 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  36.84 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 361 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.14 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.81 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.78 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0063  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000367552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.07 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0061  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000329359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3991  transcriptional regulator, LacI family protein  33.54 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173292  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  37.82 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.34 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0064  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0065  LacI family transcription regulator  32.35 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0065  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000194735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.35 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.4 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.35 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.88 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4271  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  29.5 
 
 		 345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.24 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3061  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.67 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  33.14 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  34.01 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  36.47 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.18 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1312  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  31.41 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 336 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.03 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.26 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.26 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.26 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3181  transcriptional regulator, LacI family  38.92 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.26 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.26 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.24 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.26 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  32.26 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.59 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  32.94 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  36.08 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  32.94 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.67 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  37.08 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.06 
 
 		 330 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.16 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  36.26 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  36.52 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>