33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4940 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 583 aa  1203    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  31.34 
 
 		 621 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  34.11 
 
 		 524 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  34.33 
 
 		 529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  34.65 
 
 		 672 aa  140  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  33.09 
 
 		 647 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  28.37 
 
 		 563 aa  133  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  29.43 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  30.27 
 
 		 601 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  32.8 
 
 		 604 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  30.31 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  29.58 
 
 		 583 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  28.57 
 
 		 668 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  28.81 
 
 		 506 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  29.01 
 
 		 467 aa  97.1  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  28.88 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  26.55 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  31.37 
 
 		 804 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  29.43 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  29.48 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  24.66 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  27.75 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  29.13 
 
 		 858 aa  51.6  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  30.66 
 
 		 585 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  32.03 
 
 		 585 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  29.29 
 
 		 442 aa  47.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  30.17 
 
 		 322 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  27.04 
 
 		 462 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  31.25 
 
 		 585 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  31.4 
 
 		 405 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  21.7 
 
 		 302 aa  44.3  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  26.67 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  41.51 
 
 		 444 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>