More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1069 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  89.95 
 
 
398 aa  750    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  89.45 
 
 
398 aa  748    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
398 aa  822    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  52.6 
 
 
394 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  52.31 
 
 
396 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  51.82 
 
 
402 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  52.34 
 
 
396 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  50.38 
 
 
399 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  52.04 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  52.01 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  52.45 
 
 
400 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  49.62 
 
 
398 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  51.54 
 
 
397 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  49.22 
 
 
395 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  50.77 
 
 
397 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  49.48 
 
 
394 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.41 
 
 
417 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  48.45 
 
 
395 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.95 
 
 
397 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  49.25 
 
 
399 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  46.74 
 
 
405 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  46.43 
 
 
396 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.24 
 
 
400 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  48.28 
 
 
398 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.45 
 
 
395 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.27 
 
 
399 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  48.68 
 
 
395 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.88 
 
 
396 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  47.93 
 
 
395 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  47.79 
 
 
403 aa  368  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.59 
 
 
427 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  47.31 
 
 
396 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.7 
 
 
387 aa  360  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  46.25 
 
 
426 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
418 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.16 
 
 
399 aa  359  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  47.31 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  46.92 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  45.94 
 
 
418 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  45.94 
 
 
418 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  44.94 
 
 
397 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.14 
 
 
385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 
385 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  48.17 
 
 
391 aa  346  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  44.99 
 
 
422 aa  343  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  46.81 
 
 
394 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  46.81 
 
 
394 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  46.28 
 
 
394 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  46.28 
 
 
394 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.42 
 
 
396 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  46.01 
 
 
394 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  46.01 
 
 
394 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  44.25 
 
 
394 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.74 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  45.74 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  44.67 
 
 
423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  45.74 
 
 
394 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  45.74 
 
 
394 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  44.25 
 
 
394 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  45.74 
 
 
394 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.77 
 
 
406 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  45.48 
 
 
394 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  45.48 
 
 
394 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  45.48 
 
 
394 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  45.24 
 
 
390 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  45.48 
 
 
394 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.7 
 
 
406 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.97 
 
 
406 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.7 
 
 
406 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
387 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  43.7 
 
 
397 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  44.09 
 
 
392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  45.05 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
391 aa  328  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.44 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  44.95 
 
 
395 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
403 aa  327  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  45.48 
 
 
405 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  43.88 
 
 
395 aa  326  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.36 
 
 
408 aa  326  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.86 
 
 
408 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.09 
 
 
411 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.89 
 
 
406 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.93 
 
 
413 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.86 
 
 
401 aa  323  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.88 
 
 
405 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  44.62 
 
 
390 aa  322  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.51 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  46.01 
 
 
510 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  43.72 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.45 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.01 
 
 
383 aa  320  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  42.67 
 
 
397 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0484  succinylornithine transaminase family  45.19 
 
 
406 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.07 
 
 
410 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.24 
 
 
405 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.23 
 
 
406 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
386 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
399 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>