More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0251 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  100 
 
 
180 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  95.56 
 
 
180 aa  353  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  93.33 
 
 
180 aa  345  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  46.37 
 
 
182 aa  167  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  40.22 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  43.56 
 
 
184 aa  137  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 
388 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  41.21 
 
 
181 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  38.55 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  38.92 
 
 
183 aa  127  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  37.91 
 
 
192 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  40.11 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  40 
 
 
203 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  40 
 
 
203 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  38.32 
 
 
184 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  37.36 
 
 
191 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  37.36 
 
 
191 aa  121  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  37.29 
 
 
184 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  37.91 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  34.83 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  38.82 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  35.84 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  35.8 
 
 
181 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.34 
 
 
182 aa  108  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  34.88 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  34.07 
 
 
183 aa  105  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  32.43 
 
 
190 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  34.81 
 
 
183 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  40 
 
 
189 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  34.41 
 
 
188 aa  101  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  32.97 
 
 
180 aa  101  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  39.38 
 
 
189 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  39.38 
 
 
189 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  28.73 
 
 
181 aa  97.8  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  38.27 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  32.97 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  30.6 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  36.42 
 
 
202 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.94 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  32.79 
 
 
183 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  31.9 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  29.78 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  34.13 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  31.1 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  28.09 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2299  DJ-1/PfpI family protein  31.61 
 
 
193 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  36.72 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  34.78 
 
 
191 aa  88.2  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  34.57 
 
 
189 aa  88.2  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  32.93 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  31.91 
 
 
241 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  30.22 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  30.43 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  31.93 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  33.15 
 
 
196 aa  80.9  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  32.26 
 
 
245 aa  80.9  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  32.79 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  31.45 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  30.9 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  25.15 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  32.04 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44270  predicted protein  30.81 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0563651 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  28.07 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.49 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  28.65 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  27.95 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  31.01 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  32.57 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  32.69 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  32.76 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  32.67 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  30.73 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  33.97 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  32.08 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  31.84 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.99 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  31.65 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  29.48 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  30.05 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  30.05 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  31.36 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  31.32 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  31.36 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  30.34 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  30.11 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  30.05 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  26.95 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  29.94 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  30.34 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  28.73 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  28.73 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  28.73 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  28.73 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.04 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  28.73 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  28.73 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  28.73 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  28.73 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  30.39 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  32.72 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>