236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1034 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  93.88 
 
 		 196 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  81.63 
 
 		 198 aa  340  8e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  78.06 
 
 		 196 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  76.02 
 
 		 196 aa  318  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  76.02 
 
 		 196 aa  318  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  75.51 
 
 		 196 aa  316  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  73.98 
 
 		 196 aa  315  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  73.71 
 
 		 197 aa  302  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  292  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  292  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  69.9 
 
 		 196 aa  291  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  291  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  291  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  69.9 
 
 		 196 aa  291  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  291  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  291  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  69.39 
 
 		 196 aa  291  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0474  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0472  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0535  DJ-1 family protein  69.9 
 
 		 196 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0480  DJ-1 family protein  69.39 
 
 		 196 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.757447  normal  0.338171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0493  DJ-1 family protein  68.88 
 
 		 196 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  51.28 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  52.31 
 
 		 199 aa  200  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  47.69 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1895  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  47.62 
 
 		 201 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  41.45 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  39.79 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  41.18 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  41.33 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  43.52 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  42.31 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  40.33 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  40.33 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  39.78 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  37.3 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  42.7 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  33.52 
 
 		 181 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  35.14 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44270  predicted protein  36.36 
 
 		 253 aa  107  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  38.59 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  30.94 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  36.61 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  39.15 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 388 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  35.48 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  32.8 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  35.03 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  40.93 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  37.7 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  34.62 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  33.16 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  35.48 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  33.52 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  34.08 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  32.26 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  32.61 
 
 		 182 aa  91.7  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  39.89 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  32.8 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  34.09 
 
 		 191 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  33.91 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  35.52 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  34.09 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  32.39 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  32.14 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  34.44 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  31.49 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  32.57 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  32.98 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.05 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  36.17 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  34.86 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  32.79 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  28.96 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  30.05 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.05 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  30.32 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3363  ThiJ/PfpI-family thiamine biogenesis protein  28.12 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.12 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.53 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  33.15 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0928  DJ-1/PfpI family protein  29.31 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  27.91 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  27.6 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.52 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  30.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.52 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.61 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  31.32 
 
 		 180 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  31.52 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  32.16 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.38 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  32.35 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  31.11 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  30.29 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  30.16 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  30.29 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  29.14 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  30 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>