More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1951 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
486 aa  988    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
490 aa  312  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
478 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
485 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
488 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
479 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
485 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
488 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
481 aa  292  9e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
482 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
464 aa  291  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 
464 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  36.46 
 
 
546 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
466 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
488 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.28 
 
 
495 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
466 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
491 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
490 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
477 aa  277  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
472 aa  276  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 
483 aa  276  6e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
495 aa  276  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
467 aa  273  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
467 aa  273  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
463 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
459 aa  270  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
466 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
463 aa  269  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
468 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 
509 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 
477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
469 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
490 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
463 aa  266  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
480 aa  266  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
474 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
474 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
474 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
492 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
474 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
463 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
482 aa  263  4e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
475 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
463 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
475 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
471 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
469 aa  263  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 
463 aa  263  6.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
474 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
473 aa  263  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
468 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
469 aa  262  8e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
472 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
474 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
483 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
466 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
465 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 
481 aa  260  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
881 aa  260  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
469 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
462 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
465 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
477 aa  259  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
471 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
465 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  35.27 
 
 
588 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 
480 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
473 aa  257  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 
485 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
467 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
473 aa  256  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  36.07 
 
 
518 aa  256  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
475 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
468 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
498 aa  256  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
494 aa  256  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
474 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
475 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
456 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
501 aa  253  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
449 aa  253  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0373777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>