More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0128 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 1077 aa  2221    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  49.16 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  51.96 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 882 aa  338  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  48.57 
 
 		 695 aa  323  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  48.13 
 
 		 686 aa  320  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  47.22 
 
 		 1247 aa  319  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  42.33 
 
 		 1082 aa  305  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  45.01 
 
 		 377 aa  305  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  43.44 
 
 		 787 aa  300  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  41.13 
 
 		 955 aa  300  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  41.89 
 
 		 368 aa  298  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  43.94 
 
 		 358 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.69 
 
 		 957 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.94 
 
 		 734 aa  285  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  38.81 
 
 		 358 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  38.24 
 
 		 358 aa  281  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.65 
 
 		 734 aa  279  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  38.24 
 
 		 358 aa  278  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  37.96 
 
 		 358 aa  274  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  37.68 
 
 		 358 aa  273  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 		 843 aa  266  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  50.57 
 
 		 1739 aa  265  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  41.29 
 
 		 357 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  37.57 
 
 		 381 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  37.81 
 
 		 317 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  37.81 
 
 		 317 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  34.56 
 
 		 366 aa  237  8e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  35.26 
 
 		 361 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.18 
 
 		 364 aa  232  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  39.39 
 
 		 751 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  39.39 
 
 		 751 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  47.18 
 
 		 703 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  46.51 
 
 		 1340 aa  221  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  41.73 
 
 		 994 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  42.29 
 
 		 700 aa  208  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  41.27 
 
 		 1106 aa  196  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 		 892 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 824 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  37.7 
 
 		 2401 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  39.17 
 
 		 860 aa  183  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 		 902 aa  179  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  30.79 
 
 		 372 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 		 525 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 		 1152 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 995 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  39.57 
 
 		 1075 aa  161  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  37.22 
 
 		 1837 aa  157  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 		 683 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  36.86 
 
 		 691 aa  147  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 691 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 691 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 		 557 aa  142  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 785 aa  140  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.79 
 
 		 427 aa  139  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 624 aa  139  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 746 aa  136  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 1268 aa  136  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 1359 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 679 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 		 1162 aa  129  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 415 aa  128  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 1334 aa  128  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 369 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 728 aa  127  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 996 aa  126  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 		 710 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 		 775 aa  125  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 		 410 aa  125  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 		 1435 aa  125  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 717 aa  125  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 1759 aa  124  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 280 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 401 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 		 717 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 721 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 729 aa  121  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.77 
 
 		 632 aa  121  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 1152 aa  121  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 1152 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.98 
 
 		 1644 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.98 
 
 		 1644 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 		 1038 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  29.97 
 
 		 810 aa  119  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 602 aa  118  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  37.34 
 
 		 430 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 324 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  40.53 
 
 		 411 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 635 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 662 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 880 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 1486 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 753 aa  116  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.75 
 
 		 1182 aa  114  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 617 aa  113  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 808 aa  113  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 749 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 1162 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 313 aa  112  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>