More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1592 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 359 aa  709    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  57.93 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  53.38 
 
 		 318 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  52.56 
 
 		 318 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  52.88 
 
 		 317 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  54.46 
 
 		 319 aa  329  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  51.94 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 		 313 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  55.52 
 
 		 311 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 		 316 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  47.73 
 
 		 310 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  52.26 
 
 		 312 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  53.09 
 
 		 315 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  45.98 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  48.59 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  47.74 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  49 
 
 		 318 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  47.1 
 
 		 314 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  47.13 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  54.67 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  45.63 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  45.95 
 
 		 314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  47.1 
 
 		 314 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  47.1 
 
 		 314 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  47.1 
 
 		 314 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  47.1 
 
 		 314 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  45.95 
 
 		 314 aa  289  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  47.1 
 
 		 314 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  46.77 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  43.93 
 
 		 311 aa  278  7e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  44.81 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 319 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  44.48 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 		 314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 		 314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  46 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  46 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  46 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  46 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  46 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  45.02 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  45.67 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  46.43 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  43.59 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 		 312 aa  269  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  46.03 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  46.39 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 315 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  45.67 
 
 		 315 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  42.04 
 
 		 315 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  41.14 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  42.26 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 315 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  44.98 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  46.99 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  44.08 
 
 		 304 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  44 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  43.33 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  43.33 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  43.33 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  45.15 
 
 		 297 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  46.62 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  46.67 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  43.93 
 
 		 313 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  47.04 
 
 		 323 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  47.04 
 
 		 323 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  42.36 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.15 
 
 		 319 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  47.63 
 
 		 312 aa  259  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  46.62 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  45.34 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  44.01 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  44.2 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  46.62 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  44.01 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  51.66 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.62 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  45.02 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 314 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 309 aa  255  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 315 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 		 315 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  44.69 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  44.77 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  45.6 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  39.7 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  43.53 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  39.7 
 
 		 332 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>