136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1084 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  48.95 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  43.53 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  47.75 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  41.39 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  41.39 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  38.11 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  43.15 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  43.25 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  45.02 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  43.43 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  42.68 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  38.1 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  43 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  34.98 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1577  hypothetical protein  35.43 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  38.38 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  35.46 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  36.9 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  38.4 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  39.19 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  36.18 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  36.49 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  34.43 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  40.39 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  34.42 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  35.05 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  34.77 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  34.65 
 
 		 229 aa  99  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  37 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  32.02 
 
 		 230 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  33.2 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  33.2 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  33.5 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  31.62 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  32.78 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  33.47 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  31.35 
 
 		 230 aa  90.5  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  31.23 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  33.48 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  32.47 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  32.9 
 
 		 240 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  41.94 
 
 		 229 aa  89  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  34.36 
 
 		 229 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  31.03 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  32.03 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  33.93 
 
 		 227 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  29.46 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  32.35 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  31.92 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  32.02 
 
 		 230 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  31.62 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  31.62 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  31.62 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  33 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  31.89 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  36.36 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  32.26 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  30.08 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  33.71 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  30.3 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  30.84 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  30.51 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  33.83 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  30.23 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  39.69 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  32.03 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  32.14 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  29.81 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  39.55 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  31.5 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  44.21 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  34.76 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  31.53 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  38.4 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  37.1 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  40.16 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  30.84 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  36.59 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  28.85 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  27.2 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  30.24 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  44.05 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  48.72 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  35.79 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  43.02 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  27.98 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  32.82 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  41.41 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  37.6 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  31.46 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  29.15 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  40.4 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  40.4 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  40.4 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>