46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1577 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1577  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  34.78 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  28.83 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  27.59 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  28.64 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  31.63 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  31.63 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  31.84 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  30.45 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  31.93 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  30.49 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  30.49 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  26.36 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  27.24 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  23.96 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  26.54 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  25.9 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  37.68 
 
 		 245 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  28 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  28.85 
 
 		 265 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  34.09 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  35.63 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  45.76 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  27.17 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  24.39 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  38.57 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  28.85 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2540  hypothetical protein  30.69 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  31.87 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  39.74 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  32.29 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  23.53 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  38.81 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  38.81 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  38.81 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  25.56 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  38.81 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  40.79 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  26.73 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  40.3 
 
 		 240 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  23.18 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  34.02 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  26.77 
 
 		 234 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>