69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1444 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  483  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2407  hypothetical protein  58.16 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  56.84 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  58.16 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3043  putative lipoprotein  57.74 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2255  hypothetical protein  59.73 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  58.58 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3520  hypothetical protein  59.28 
 
 		 239 aa  274  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  54.04 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09830  hypothetical protein  46.41 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.928804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  28.06 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  26.07 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  24.31 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  31.87 
 
 		 230 aa  62  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  31.25 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  29.73 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  24 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  26.07 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  31.11 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  30.43 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  35 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  25.55 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  32.29 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  32 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  28.87 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  27.84 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  27.84 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  27.84 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  27.84 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  26.18 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  25.7 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  28.04 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  33.08 
 
 		 256 aa  52  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  26.29 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  24.54 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  24.43 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  26.29 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  26.29 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  26.29 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  26.95 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  27.1 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  24.22 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  24.16 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  23.61 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  25.31 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  23.08 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  32.05 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  23.33 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  26.44 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  25.82 
 
 		 278 aa  45.4  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  30.77 
 
 		 266 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  27.41 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  25 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  34.15 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  23.22 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  28.05 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  32.94 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  21.58 
 
 		 323 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  24.37 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>