54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09830  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.928804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  50.43 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  51.82 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3043  putative lipoprotein  49.77 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  50.21 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  46.41 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2255  hypothetical protein  48.42 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3520  hypothetical protein  47.96 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2407  hypothetical protein  46.84 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  25.4 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  23.96 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  25 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  30.4 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  30.16 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  26.7 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  27.41 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  24.86 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  29.46 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  32.29 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  27.89 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  29.25 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  25.22 
 
 		 263 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  28.68 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  28.68 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  28.68 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  26.26 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  22.97 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  22.71 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  27.52 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  28.46 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  25.84 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  28.46 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  28.43 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  27.64 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  27.82 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  27.06 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  22.07 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  24.7 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  22.86 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  21.68 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  23.3 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  23.35 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  22.58 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  27.08 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  23.7 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  36.76 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  26.34 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  22.73 
 
 		 280 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  36.76 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  26.27 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>