70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1590 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  93.8 
 
 		 242 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  56.17 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  57.85 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  59.55 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3043  putative lipoprotein  52.47 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2407  hypothetical protein  49.57 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2255  hypothetical protein  52.04 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3520  hypothetical protein  51.13 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09830  hypothetical protein  50.21 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.928804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  25.64 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  28.44 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  31.18 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  39.78 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  39.02 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  38.82 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  35.64 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  37.65 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  37.08 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  29.27 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  35.29 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  35.96 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  36.47 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  42.65 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  35.96 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  35.96 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  25.79 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  35.29 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  30.81 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  39.71 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  30.77 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  29.29 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  23.73 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  26.82 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  23.73 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  25.27 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  23.63 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  24.86 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  24.86 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  26.53 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  27.33 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  24.28 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  25.44 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  23.16 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  31.19 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  35.05 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  27.75 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  26.99 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  25.12 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  26.52 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  26.99 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  25.71 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  27.62 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  25.95 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  36.99 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  25.79 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  39.44 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  30.53 
 
 		 281 aa  48.5  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  32.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  31 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  31.01 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  31.13 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  35.23 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  22.02 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  34.85 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  22.93 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  32.47 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>