36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2255 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3520  hypothetical protein  99.16 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2407  hypothetical protein  93.31 
 
 		 239 aa  453  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3043  putative lipoprotein  87.87 
 
 		 239 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  59 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  51.88 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  49.58 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  51.46 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  48.72 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09830  hypothetical protein  47.26 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.928804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  23.41 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  28.8 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  23.39 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  33.01 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  29.92 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  29.92 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  25.5 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  29.92 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  34.33 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  29.31 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  26.96 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  26.79 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  27.43 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  29.49 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  21.74 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  29.49 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  29.49 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  29.33 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  34.57 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  26 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  31.87 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  24.14 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  22.61 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  31.87 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>